摘要:研究猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)NADC30株的NSP1基因的生物信息。NSP1基因全长1149 bp。NSP1基因编码的蛋白质具有383个氨基酸,分子质量为43.2 kDa,等电点(pI)为8.95,属于疏水性蛋白,不稳定系数为51.21,属于不稳定蛋白,没有信号肽和跨膜螺旋结构。NSP1基因编码的蛋白质具有多个强抗原性位点,亚细胞定位预测表明抗原性位点可能位于细胞质中。遗传进化分析显示,基因编码蛋白序列相对保守,没有发生氨基酸插入或缺失。NADC30株与SD-A19株的遗传距离较近,但与CHsx1401株的遗传距离较远。
关键词: NADC30;NSP1;生物信息;序列分析;