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基于网络药理学和分子对接探讨五指毛桃汤防治COVID-19的作用机制
2023-10-25 16:00 孙彦刚,谢莎,梁绿圆 
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摘要:运用网络药理学和分子对接的思路和方法,研究五指毛桃汤预防新冠肺炎(Coronavirus disease 2019,COVID-19)的作用机制。从ETCM、TCMSP、SwissADME、SwissTargetPrediction等数据库和文献中获取五指毛桃汤各味中药的主要有效成分和作用靶点,导入Cytoscape 3.8.0软件绘制药物有效成分-靶点网络图。通过TTD、GeneCards、OMIM、DrugBank、pharmgkb等数据库筛选疾病基因,将疾病基因与靶点基因取交集,通过STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)关系图,筛选得到核心基因。利用R语言软件编辑脚本文件进行GO功能和KEGG通路分析。最后,利用AutoDock4及Pymol 2.2.0平台进行分子对接分析,预测活性化合物与关键靶点的亲和力。五指毛桃汤PPI关系图涉及7味中药、155个活性成分和749个靶基因。五指毛桃汤作用于COVID-19的核心靶点基因为信号转导和转录激活因子1(STAT1)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src(SRC)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶3(M...更多

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